中国科学院深圳先进技术研究院是由中国科学院、深圳市政府协商共建的具有独立法人资格的非营利性国家科研机构。先进院隶属于中国科学院，实行理事会领导下的院长负责制，同时设立学术委员会、工业委员会。经过近2年的发展，先进院逐步建立和形成三所两中心发展格局：先进集成技术研究所、生物医学与健康工程研究所、先进计算与数字工程研究所、开放技术平台、工程中心。截至2009年4月底，先进院共622人，其中博士155人（海外背景107人）。先进院将于2010年达到1200人，并计划于2015年达到3000人。
集成所由中国科学院、深圳市人民政府、香港中文大学共建，致力于现代装备业及服务业的基础性、前瞻性、战略性研究，以机器人与智能系统、汽车电子与新能源、精密加工与新材料为主要科研方向；医工所致力于低成本、小型化、集成化、网络化、数字化和智能化的创新医疗器械的研究，为解决高血压、心脏病、癌症等重大疾病、医疗支出不断攀升、人口老龄化带来的疾病困扰等问题做出应有的贡献。数字所面向快速城市化与城市工业化对城市环境、资源提出的迫切需求，发展高性能计算与网格计算应用技术，以数字城市、数字生态、数字健身、工业设计与仿真模拟技术的应用开发为主要研究方向。
先进院在设立之初将自己定位于国际一流的工业研究院，为保持人才一流，从全球招聘博士以上人员。先进院将通过先进的人力资源体系和激励措施、创新文化和成果转化机制吸引并培养一流人才。以应用为源动力，基础创新、集成创新相结合的方式，力争依靠科技进步和创新，带动生产力质的飞跃，为推动国家和区域经济社会的全面、协调、可持续发展贡献应有的助力。
先进院的发展已写入深圳市08年9月出台的《深圳国家创新型城市总体规划（2008～2015）》：依托先进院组建深圳产业创新研究院；依托先进院争取和建设国家华南超级计算中心。也已写入08年12月国务院正式颁布的《珠江三角洲地区改革发展规划纲要(2008-2020年)》指出：深化国家与地方创新联动机制，积极推进中国科学院与广东省自主创新战略合作，加快建设中科院深圳先进技术研究院等共建项目。